اساس روش میکرواری بر پایه جفت شدن دو رشته‌ی DNA و شکل گیری پیوندهای هیدروژنی بین این دو رشته است. این فناوری امکان غربال همزمان و سریع هزاران ژن را فراهم می‌سازد و یک تصویر کلی از فعالیت رونویسی سلول در شرایط مختلف ارائه می‌کند. تفاوت بیان ژن با استفاده از تفاوت معنی‌دار سطوح بیان در بین دو یا تعداد بیشتري از شرایط مختلف ارزیابی می‌شود. نتایج آزمایش‌های میکرواری می‌تواند حجم زیادی از داده‌ها را تولید کنند که به محققان اجازه می‌دهد تا وضعیت کلی سلول یا ارگانیسم را ارزیابی کنند. تحلیل حجم زیاد داده‌ها دشوار می‌باشد و نیاز به روش‎هاي پیچیده‌اي براي داده کاوي، تفسیر و بیان دوباره است.